县境原是古淮夷的一部分,春秋初属吴国,吴亡属越,战国时属楚,秦初为东海郡属地,秦末为东阳郡属地,汉初为射阳县东境,西汉元狩四年射阳、盐渎分治,境内大部分为盐渎县辖地,东晋义熙七年,射阳县废置,盐渎县改盐城县、县境东部仍属盐城县,西部划属新立左乡县,隋大业九年县境分属新安、安乐、射阳三县,唐武德八年复立盐城县,县境全为盐城县地,清雍正九年县城东北部属阜宁县。
1941年9月、盐城县划县分治,成立建阳县,因与福建省建阳县同名,于1951年7月取建阳、湖垛(今近湖)两镇的首字为名改称建湖县。建县后,先后隶属盐阜行政公署、盐阜分区、苏皖边区第五行政区、苏中行署盐城行政区、江苏省盐城专区、江苏省盐城地区。1983年实行市管县新体制,为盐城市属县之一。